نعیین ساختمان آنزیم لیزوزیم در ph= 7.0 توسط روش 2d 1h nmr

آنزیم لیزوزیم( ec3.2.1.17 ) (hen egg white lysozyme) شناخته شده ترین عضو از خانواده ی بزرگ گلیکوهیدرولازها است. این آنزیم پیوند گلیکوزیدی (?1?4) بین دو زیر واحد namوnag در ساختار پپتیدوگلیکانی دیواره ی باکتری های گرم مثبت را می شکند. این آنزیم در 4ph= بوسیله ی روش 2d1h nmr تعیین ساختار شده است. در این ph، آنزیم دارای حداکثر پایداری و حلالیت است ولی فاقد فعالیت فیزیولوژیک می باشد. بمنظور بررسی ساختار آنزیم در حالت فعال، لیزوزیم در7ph= و در دمای35 درجه تعیین ساختمان شد. طیف حاصل در این ph دارای نسبت سیگنال به نویز کمتری نسبت به طیف پروتئین در 4ph= است و پروتئین دارای انعطاف پذیری بالاتری است. از آنجا که در این مورد، ph سبب تغییرات ساختاری بزرگ در آنزیم نشده است ازساختار محاسبه شده در 4ph= به عنوان الگو برای تعیین ساختمان در 7 = ph استفاده شد. تغییرات جابه جایی های شیمیایی اتم های هیدروژن در اینph مورد بررسی قرار گرفت. بارمنفی کسب شده توسط asp,glu بر مقدار جابه جایی های شیمیایی آنها و اسیدهای آمینه ی مجاورشان تأثیر می گذارد. از آنجا که جایگاه کاتالیتیک آنزیم از این دو اسید آمینه(glu 35, asp 52) تشکیل شده است، تغییراتی که بر اثر تغییر ph در ساختار و انعطاف پذیری پروتئین ایجاد می شود برای عملکرد آن ضروری است.